Wasserball wird in Thun seit 1970 gespielt – zuerst als „Wasserball-Team-Thun“. Der Klub gehörte da noch zum Schwimmklub Thun. Im 2000 wurde dann der Wasserballklub Thun gegründet.
Am Meisterschaftsbetrieb nehmen zur Zeit eine Herren-Mannschaft, ein Frauen-Team, ein U20-Frauen-Team, eine U15 Nachwuchs und eine U13 Nachwuchs-Mannschaft teil.